Responsable Plateforme Analyse de Données et d'Images H/F

Collège de France 1530

Activités principales
- Définir en collaboration avec les utilisateurs de la plate-forme, une stratégie de traitement et d'analyse des données

- Mettre en oeuvre la stratégie retenue en utilisant les logiciels du domaine et en proposant en collaboration avec les équipes des solutions de traitement et d'analyse à façon

- Développer les boites à outils logiciels nécessaires à la réalisation de l'analyse

- Former en expert les utilisateurs et collaborateurs de la plate-forme aux technologies mises à disposition

- Rédiger les notes techniques et les tutoriaux relatifs aux méthodes de traitement et d'analyse d'images et aux ressources logicielles disponibles

- Conseiller les utilisateurs sur les possibilités techniques, leurs limites, les méthodes d'analyse, leur interprétation, et en assurer le suivi

- Participer à la gestion des moyens techniques, humains et financiers alloués

- Organiser et contrôler l'utilisation collective de l'appareillage et des postes de travail

- Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité

- Assurer l'application des principes et des règles d'hygiène et de sécurité

Compétences
- Utiliser en expert les logiciels dédiés au traitement et à l'analyse des images (Matlab ,Imaris, Fiji, Icy, Napari, Qpath)

- Maîtriser les langages de programmation Python, MATLAB, Java, C/C++.

- Expérience ou formation avancée en Machine Learning : Apprentissage supervisé, classification, CNN (convolutional neural network)

- Maîtriser au moins un des frameworks de deep learning (OpenCV, Scikit, TensorFlow ou Pytorch)

- Bonne connaissance des méthodes conventionnelles d'analyse d'images (algorithmes de segmentation, du suivi des objets, de la reconnaissance des formes.

- Connaissance générale des bases de données images et de leur mise en place sur serveur OMERO

- Maîtriser le développement de plugins sous Fiji/ImageJ, QuPath.

- Maîtriser l'environnement Linux

Connaissances
- Biologie : méthodologie appliquée (connaissance générale)

- Environnement et réseaux professionnels (connaissance générale)

- Réglementation en matière d'hygiène et de sécurité

- Cadre légal et déontologique

- Langue anglaise : C1

Compétences comportementales
- Capacité de raisonnement analytique

- Créativité / Sens de l'innovation