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Chercheur en Écologie et Évolution Computationnelles H/F

Institut de Recherche pour le Développement (IRD)

  • Cayenne - 973
  • CDD
  • Télétravail partiel
  • Bac +5
  • Service public d'état
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Les missions du poste

Votre mission

Sous la direction de Louise Brousseau, coordinatrice du projet DOPAMICS vous aurez la responsabilité du Work Package 4 (WP4), qui vise à intégrer les données hétérogènes acquises au cours des Work Packages 1 à 3, et à décrypter les relations entre génome et phénotype, en étroite collaboration avec un doctorant travaillant sur la diversité génomique et l'histoire microévolutive (WP3).

Dans ce cadre vos activités seront les suivantes:

- Intégrer les données hétérogènes (génomiques, phénotypiques, environnementales) produits par le projet.
- Réaliser des GWAS afin d'identifier les loci associés aux caractères phénotypiques (biomécaniques et métabolomiques).
- Estimer la taille d'effet des loci identifiés et quantifier la part génétique des variations phénotypiques.
- Développer des modèles bayésiens et/ou des approches d'apprentissage profond pour prédire les variations phénotypiques à partir de données multi-sources.
- Développer des modèles prédictifs pour prédire les changements de la diversité génétique des populations de palmiers sous l'effet du changement climatique et des pressions anthropiques.

Ce poste vous offrira une opportunité unique de travailler à l'interface entre la génomique évolutive, la génétique quantitative et la biologie computationnelle, tout en contribuant à une meilleure compréhension de la biodiversité amazonienne et de sa résilience face aux changements globaux.

Vous avez développé les compétences suivantes :

- Solides connaissances en écologie évolutive, génétique des populations, génétique quantitative.
- Solides connaissances en analyse de données, biostatistiques, modélisation écologique et visualisation de données.
- Expérience en GWAS, modélisation bayésienne et/ou apprentissage automatique appliqué à des données biologiques.
- Compétences en programmation (R, Python) et gestion de jeux de données omiques à grande échelle.
- Publications dans le domaine.
- Connaissance ou intérêt pour la biodiversité tropicale.
- Langues : français, anglais niveau B1-B2.

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Vous faites preuves des qualités humaines suivantes :

- Bonnes capacités d'organisation, autonomie et esprit d'initiative.
- Goût pour le travail en équipe et la collaboration interdisciplinaire.
- Forte motivation pour travailler en Guyane française et participer à des activités de médiation scientifique auprès du grand public.
- Curiosité scientifique et esprit critique.
Vous êtes titulaire d'un diplôme de niveau 8, en génomique évolutive, génétique quantitative, biologie computationnelle ou domaine équivalent.

Pour postuler :

L'IRD, au cours de votre parcours professionnel, vous accompagne dans le développement de vos compétences.

L'institut met à votre disposition un panel d'outils tel que le parcours digital d'intégration, l'accès à la formation permanente, à la promotion et la mobilité.

L'IRD offre, en fonction des activités, la possibilité de télétravailler de 1 à 3 jours hebdomadaires.

En rejoignant l'IRD, vous bénéficierez:

- De 32 jours de congés + 13 RTT (pour un temps plein à 38h30 hebdomadaire).
- Tickets restaurants OU d'une restauration collective (en fonction du site).
- Souscription annuelle (facultative) à l'Association des Œuvres Sociales: prestations vacances-loisirs et sportives-culturelles.
- Participation à hauteur de 15€/mois pour la protection sociale.

EVOLUTION - SCIENCES DES DONNEES - MODELISATION ET DEEP LEARNING

Contexte et Objectifs

Comprendre la façon dont les processus microévolutifs façonnent la biodiversité des forêts amazoniennes reste l'une des questions centrales en écologie et évolution, car cela sous-tend notre capacité à prédire les réponses des espèces au changement climatique et aux pressions anthropiques. Les palmiers sont très abondants et souvent hyperdominants dans les forêts amazoniennes, ce qui en fait un groupe clé de ces écosystèmes. Utilisés depuis l'époque précolombienne pour l'alimentation, les fibres et les usages médicinaux, ils sont à la fois culturellement importants et économiquement précieux, et ils constituent des indicateurs biologiques des paysages précolombiens.

Le projetDOPAMICS, financé par l'ERC, vise à démêler les contributions respectives de l'adaptation au climat et des activités humaines anciennes (gestion des paysages, domestication) à la diversité génomique et phénotypique de cinq espèces de palmiers amazoniens, afin d'éclairer l'histoire évolutive des forêts amazoniennes et leur résilience future.

La carte

97300 Route de Montabo

97300 Cayenne

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Publiée le 14/10/2025 - Réf : 2025-2075673

Chercheur en Écologie et Évolution Computationnelles H/F

Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
  • Cayenne - 973
  • CDD
Publiée le 14/10/2025 - Réf : 2025-2075673

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