Chercheur en Microbiologie - Microscopie - Biochimie H/F CNRS

Etude de la synthèse des acides téichoïques chez Streptococcus pneumoniae (projet NANOWALL)
(microscopie de fluorescence super-résolue dSTORM; biochimie)
La paroi bactérienne est une structure essentielle qui confère la résistance mécanique de la cellule, maintient sa forme et la protège contre le stress osmotique. Chez les bactéries à Gram positif, elle est principalement composée de deux macromolécules essentielles : le peptidoglycane (PG), un réseau tridimensionnel de chaînes glycanes réticulées par des chaînes peptidiques, et les acides téichoïques (TA), des polysaccharides linéaires complexes attachés soit au PG, soit à la membrane cytoplasmique. Ces composants sont indispensables à la croissance, à la division cellulaire et aux interactions avec l'environnement, y compris avec l'hôte. Malgré leur importance, la coordination entre l'assemblage du PG et des TA reste mal comprise. Ce projet vise à élucider la dynamique de la synthèse et de la maturation du PG et des TA, ainsi qu'à identifier les interactions moléculaires clés reliant ces deux processus. Pour ce faire, nous adopterons une approche intégrative combinant microbiologie, chimie bio-orthogonale, microscopie de fluorescence super-résolue, biochimie et RMN (en collaboration), appliquée à des souches sauvages et mutantes du pathogène humain Streptococcus pneumoniae.
Activités
1. Réaliser des travaux de recherche, de la mise en place de l'expérience à la rédaction des résultats:
- Maitriser la bibliographie dans le périmètre du projet et au-delà
- Marquer la paroi de cellules de S. pneumoniae grâce à la chimie click
- Collecter & analyser des données en microscopie de fluorescence (basse et haute résolution, dSTORM)
- Préparer des extraits de paroi bactérienne pour des analyses en biochimie
- Mettre en forme les résultats pour des présentations orales en anglais
- Être force de proposition pour le développement des expériences et des questions biologiques
- Rédiger en anglais des protocoles et des articles de recherche pour publication des travaux réalisés

2. Participer à la vie du laboratoire :
- Participer à la vie en commun du groupe (logistique, stocks de réactifs, rangement, ...)
- Aider à la supervision de stagiaires
- Participer aux évènements scientifiques de l'Institut
Compétences
- Microbiologie
- Biochimie(protéines recombinantes, chromatographie, pull-downs, ...)
- Biophysique (techniques de caractérisation d'interaction protéines-ligand)
- Microscopie de fluorescence, traitement de données appliqué à l'analyse d'images
- Connaissances mathématiques de base (proportionnalités) et analyses statistiques
- Connaissances des mécanismes moléculaires de la division bactérienne, synthèse de la paroi
- Langue anglaise : B2 souhaité (selon le cadre européen commun de référence pour les langues)
- Grande capacité d'autonomie
- Pro-activité dans la recherche, curiosité scientifique
- Sens de l'organisation et rigueur
- Ouverture d'esprit et écoute
- Bon sens du relationnel et capacité d'intégration et d'adaptation à l'équipe
- Sens de la communication (écrite et orale) et capacité à rendre compte de vos travaux
Contexte de travail

Situé sur le Polygone scientifique de Grenoble (ESRF/ILL/EMBL/IBS), l'Institut de Biologie Structurale (IBS) est un acteur d'envergure nationale et internationale dans le domaine de la biologie structurale intégrée. A la fois centre de recherche, plateau technique, site d'accueil et de formation scientifique, l'IBS a pour vocation le développement de recherches en biologie structurale, un champ de recherche capital pour la compréhension des mécanismes biologiques fondamentaux. Il s'appuie sur 12 plateformes à la pointe de la technologie.
En tant qu'unité mixte de recherche (CEA-CNRS-UGA) l'IBS est composé de 19 groupes de recherche, chacun de ces groupes proposant une approche multi-disciplinaire, aux frontières de la biologie, de la physique et de la chimie, en cohérence avec 3 axes de recherche. Près de 300 personnes y travaillent (chercheurs, doctorants, ingénieurs, techniciens et étudiants) dans un environnement multiculturel et international.
La personne recrutée rejoindra le groupe dirigé par Cécile Morlot, qui étudie les mécanismes moléculaires liés à l'enveloppe cellulaire bactérienne en utilisant des approches intégrées de biologie structurale et cellulaire. Les thèmes de recherche incluent la paroi cellulaire chez Streptococcus pneumoniae, ses mécanismes de synthèse et les antibiotiques qui les ciblent, ainsi que les grands complexes protéiques associés à l'enveloppe de la spore chez Bacillus subtilis. (https://www.ibs.fr/research/research-groups/pneumococcus-group-c-morlot/).
Situé sur le Polygone scientifique de Grenoble (ESRF/ILL/EMBL/IBS), l'Institut de Biologie Structurale (IBS) est un acteur d'envergure nationale et internationale dans le domaine de la biologie structurale intégrée. A la fois centre de recherche, plateau technique, site d'accueil et de formation scientifique, l'IBS a pour vocation le développement de recherches en biologie structurale, un champ de recherche capital pour la compréhension des mécanismes biologiques fondamentaux. Il s'appuie sur 12 plateformes à la pointe de la technologie.
En tant qu'unité mixte de recherche (CEA-CNRS-UGA) l'IBS est composé de 19 groupes de recherche, chacun de ces groupes proposant une approche multi-disciplinaire, aux frontières de la biologie, de la physique et de la chimie, en cohérence avec 3 axes de recherche. Près de 300 personnes y travaillent (chercheurs, doctorants, ingénieurs, techniciens et étudiants) dans un environnement multiculturel et international.
La personne recrutée rejoindra le groupe dirigé par Cécile Morlot, qui étudie les mécanismes moléculaires liés à l'enveloppe cellulaire bactérienne en utilisant des approches intégrées de biologie structurale et cellulaire. Les thèmes de recherche incluent la paroi cellulaire chez Streptococcus pneumoniae, ses mécanismes de synthèse et les antibiotiques qui les ciblent, ainsi que les grands complexes protéiques associés à l'enveloppe de la spore chez Bacillus subtilis. (https://www.ibs.fr/research/research-groups/pneumococcus-group-c-morlot/).
Contraintes et risques

Sans.
La recherche se fera indifféremment en français ou anglais, néanmoins il est attendu que le candidat non-francophone s'efforce d'apprendre les bases du français afin de faciliter la communication et son intégration dans le laboratoire.
Sans.
La recherche se fera indifféremment en français ou anglais, néanmoins il est attendu que le candidat non-francophone s'efforce d'apprendre les bases du français afin de faciliter la communication et son intégration dans le laboratoire.