Ingénieur·e de Recherche en Modélisation et Biologie Structurale H/F CNRS

Le Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM) recrute, dans le cadre d'un projet financé par la fondation ARC, un/une Ingénieur-e de Recherche en contrat à durée déterminée, pour rejoindre l'équipe iSCB dirigée par Xavier Morelli et Yves Collette.
Sous la responsabilité scientifique du Dr Philippe Roche, la personne recrutée contribuera à l'identification et l'optimisation de modulateurs de l'interaction entre la protéine WRN (hélicase de l'ADN) et le facteur de réparation Ku, en mettant en oeuvre des approches de chémoinformatique, de modélisation moléculaire et de biologie structurale.
Activités
- Sélectionner des analogues commerciaux d'inhibiteurs déjà identifiés.
- Réaliser des études de relation structure-activité sur la base des tests biologiques réalisés par les partenaires.
- Mettre en place des protocoles d'optimisation des composés se basant sur l'approche DOTS
- Étudier l'interaction des meilleurs composés par des approches computationnelles telles que le docking ou l'échantillonnage conformationnel
- Participer à l'analyse structurale des complexes protéine-modulateurs en collaboration avec les partenaires,
- Analyser, interpréter et présenter des résultats dans le cadre du projet financé par la fondation ARC.
- Participer aux échanges scientifiques au sein de l'équipe iSCB et avec les partenaires du projet.
- Rédiger des rapports techniques et contribuer, si nécessaire, aux publications scientifiques.
Compétences
Connaissances
- approfondie en modélisation moléculaire
- approfondie en biologie structurale
- notions de programmation (python) et bases de données (SQL)
- Bon niveau d'anglais scientifique (lu, écrit, parlé)

Compétences attendues
- Recherche d'analogues par des approches chémoinformatiques.
- Solides connaissances en chimie computationnelle, modélisation moléculaire appliquée aux interactions protéine-protéine.
- Analyse structurale des interactions des molécules avec la cible
- Avoir une bonne adaptation à un environnement interdisciplinaire
- Savoir informer et rendre compte.
- Travailler en interaction et transmettre ses connaissances.
- Organiser et gérer les priorités.
- Tenir un cahier de laboratoire, rédiger des protocoles de sélection et d'optimisation des molécules.
Contexte de travail

Le Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM) est une unité mixte de recherche (UMR) sous les tutelles de l'INSERM, CNRS, Institut Paoli-Calmette et d'Aix-Marseille Université. Plus de 400 chercheurs y mènent des travaux en adoptant des approches multidisciplinaires et de recherche translationnelle, en collaboration avec les cliniciens de l'hôpital. L'équipe iSCB mène des recherches visant à identifier, comprendre, valider et cibler les voies de signalisation impliquées dans les cellules tumorales.
Un projet collaboratif financé par la fondation ARC vise à développer de nouveaux inhibiteurs ciblant l'interaction Ku/WRN, à partir de composés identifiés avec la chimiothèque Fr-PPIChem. L'objectif est de caractériser ces molécules et leurs analogues commerciaux, puis de les optimiser par des approches de chimie médicinale, de biophysique, de modélisation moléculaire et de biologie structurale.
Le Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM) est une unité mixte de recherche (UMR) sous les tutelles de l'INSERM, CNRS, Institut Paoli-Calmette et d'Aix-Marseille Université. Plus de 400 chercheurs y mènent des travaux en adoptant des approches multidisciplinaires et de recherche translationnelle, en collaboration avec les cliniciens de l'hôpital. L'équipe iSCB mène des recherches visant à identifier, comprendre, valider et cibler les voies de signalisation impliquées dans les cellules tumorales.

Contraintes et risques

Néant