Post-Doctorant IA Générative pour la Translation Inter-Champs Magnétiques d'Images Irm Flair Cérébrales Amélioration de la Qualité Diagnostic par Passage aux Ultra-Haut Champs H/F INRIA

Post-Doctorant F/H IA générative pour la translation inter-champs magnétiques d'images IRM FLAIR cérébrales : Amélioration de la qualité diagnostic par passage aux ultra-haut champs

Type de contrat : CDD

Niveau de diplôme exigé : Thèse ou équivalent

Fonction : Post-Doctorant

Niveau d'expérience souhaité : Jusqu'à 3 ans

A propos du centre ou de la direction fonctionnelle

Le centre de recherche Inria de Saclay a été créé en 2008. Sa dynamique s'inscrit dans le développement du plateau de Saclay, en partenariat étroit d'une part avec le pôle de l'Université Paris-Saclay et d'autre part avec le pôle de l'Institut Polytechnique de Paris. Afin de construire une politique de site ambitieuse, le centre Inria de Saclay a signé en 2021 des accords stratégiques avec ces deux partenaires territoriaux privilégiés.

Le centre compte 39 équipes-projets , dont 27 sont communes avec l'Université Paris-Saclay ou l'Institut Polytechnique de Paris. Son action mobilise plus de 600 personnes , scientifiques et personnels d'appui à la recherche et à l'innovation, issues de 54 nationalités.

Contexte et atouts du poste

Dans le cadre d'une collaborationpublique avec l'institut de radiologie de l'école de médecine de l'Université de São Paulo,l' objectif est dedévelopperun logiciels'appuyant sur une IA générative pour générer des images d'imagerie par résonance magnétique (IRM) à 7 Tesla (T) à partir d'images correspondantes acquises à des intensités de champ magnétique standard en clinique (par exemple, 1,5 T ou 3T), afin d'améliorer la résolution spatiale des images IRM, leur qualité (contraste et rapport signal à bruit) et, en fin de compte, leur capacité de diagnostic.

Plusieurs séjours serontprévus pour ce poste à São Paulopour collaborer avec l'équipe partenaire (Dr Fabiola Macruz) à l'INRAD au sein des cliniques universitaires de l'école de médecine de l'Université de São Paulo. Les frais de déplacements seront pris en charge dans la limite du barème en vigueur.

Mission confiée

Missions :
Avec l'aide de Philippe Ciuciu et de Chaithya Giliyar-Radhakrishna au sein de MIND, la personne recrutée sera amenée àconsolider une base de données d'examens IRM cérébrale (images FLAIR - Fluid Attenuated Inversion Recovery) acquises chez des sujets sains à 3T et 7T pour servir d'entraînement et de conditionnement à des modèles d'IA générative (réseau adversariel génératif ou GAN, modèle de diffusion ou à énergie)qu'il faudra développer, entraîner, tester et valider d'abord sur des sujets sains avant une translation possible en clinique.

Pour une meilleure connaissance du sujet de recherche proposé :
Undescriptif du sujet de recherche, un état de l'artet une bibliographie sont disponibles à l'URL suivante, n'hésitez à pas à vous y connecter : .

Collaboration :
La personne recrutée sera également en lien avecle Dr Fabiola Macruz, neuroradiologue et chercheuse au seinde l'institut de radiologie des cliniques universitaires de l'école de médecine de l'Université de São Paulo au Brésil, quiapportera son expertise duale en IA pour l'IRM eten diagnostic neuroradiologique, pour la validation méthodologique et l'application des réseaux de neurones développés sur une pathologie ciblée (e.g. sclérose en plaques ou épilepsie) et leur validation clinique.

Responsabilités :
La personne recrutée à la charge dePhilippe Ciuciu prendra des initiatives pour prétraiter et organiser les données (bases de données ouvertes - e.g. IDEAS, OpenNeuro et EPISURG - et privées de NeuroSpin d'images IRM acquises à différentes intensités de champ magnétique, par exemple 3T et 7T ou 1,5T et 3T) nécessaires à l'entraînement des modèles d'IA générative, concevoir les meilleures architectures en termes d'IA générative (GAN, modèles de diffusion, modèles à base d'énergie), entraîner ces modèles, les valider et les comparer selon des critères quantitatifs et qualitatifs sur des images de sujets sains. Fort de ce parangonnage, les modèles les plus prometteurs seront ensuite testés sur des applications cliniques qui sera choisie en étroite collaboration avec notre équipe partenaire brésilienne.

Pilotage/Management :
La personne recrutée aura la responsabilité dedévelopper le logiciel de synthèse des images IRM FLAIR à très haut champ magnétique (e.g. 7T) à partir des images collectées à champ plus faible sous PyTorch, d'en faire un package Python autonome, déployable dans différents environnements, y compris clinique, d'écrire les tests et la documentation, et d'en assurer la dissémination.

Principales activités

Principales activés :

- Analyser les bases de données disponibles d'IRM cérébrales appariées acquises à 1,5 ou 3 tesla et 7 tesla ;
- Développer les IA génératives pour synthétiser des IRM FLAIR à 7 tesla à partir d'images à 1,5 ou 3 tesla ;
- Tester et valider ces modèles sur sujets sains ;
- Collaborer avec notre partenaire clinique brésilienne pour une évaluation sur des pathologies ciblées.

Activités complémentaires :

- Rédigerla documentation du logiciel ;
- Présenter l'avancée des travauxà des conférences internationales en IA, IRM et radiologie ;
- Rédiger les publications associées et disséminer les résultats auprès des communautés académique et clinique.

Compétences

Compétences techniques et niveau requis : Doctorat en imagerie biomédicale, apprentissage automatique, neuroimagerie. Excellence en apprentissage profond, en IA générative (GAN, VAE, etc.), et en programmation scientifique avec une totale maîtrise de Python et de l'environnement PyTorch.

Langues : Excellente compétences en anglaisà l'écrit et à l'oral. La maîtrise du français et/ou du portugais sont un plus mais non obligatoires.

Compétences relationnelles : Une bonne capacité d'écoute, de communication et d'adaptation à différents types d'interlocuteurs est nécessaire car ce projet de recherche est interdisciplinaire et mobilise des collaborateurs en IA, IRM et en neuroradiologie.

Compétences additionnelles appréciées :Maîtrise des concepts de base de l'IRM.Bonnes connaissances en traitement du signal.

Avantages

- Restauration subventionnée
- Transports publics remboursés partiellement
- Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
- Possibilité de télétravail et aménagement du temps de travail
- Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
- Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des oeuvres sociales d'Inria)

Rémunération

2788 € brut/mois