Ingénieur Bioinformatique - Datamanagement H/F AP-HP

MétierChefferie de Projet - MOAType de contratTitulaire ou CDIRémunération51 500 - 64 000 Selon profilPrésentation du service
La Direction des Services Numériques (DSN) de l'AP-HP fournit des services numériques aux patients et aux professionnels, dont le dossier patient, des systèmes pour la biologie et l'imagerie, un espace patient, des progiciels de gestion et une offre bureautique sur plus de 70 000 postes. Elle gère ses infrastructures dans deux datacenters avec son propre réseau. Elle fournit également des services pour la réutilisation secondaire des données de santé, au service du pilotage, de la recherche et de l'innovation, au travers de son entrepôt de données de santé. Son support informatique centralisé collabore avec les directions des systèmes d'information des 6 GHU. Plus de 500 professionnels contribuent à la transformation numérique.

La plateforme Big Data de l'AP-HP héberge un entrepôt de données de santé et des outils pour la mise à disposition et le traitement de données massives. Elle intègre rapidement les données cliniques des systèmes d'information hospitaliers pour les utiliser via des outils spécifiques ou des interfaces FHIR. Contenant les données médicales de plus de 11 millions de patients, elle standardise les données selon les normes internationales (OMOP, FHIR, CIM...), soutenant actuellement plus de 70 projets de recherche.

Vos missions
Au sein du pôle Innovation et Données de la DSN de l'AP-HP, la plateforme de bioinformatique MOABI a pour missions :

- La centralisation progressive du stockage des données de génomique produites au niveau de 39 hôpitaux

- Leur analyse dans le cadre de processus maitrisés et normalisés

- La mise à disposition d'outils d'exploitation des résultats

- L'animation d'une communauté bioinformatique de l'AP-HP regroupant plusieurs dizaines d'ingénieurs

- Le support technique et scientifique, la formation

- La veille technologique en bioinformatique

La stratégie mise en place à MOABI pour le développement de pipelines d'analyses permet de garantir un niveau de standardisation, de traçabilité et de reproductibilité de qualité industrielle.

Afin de renforcer ses activités bioinformatiques, la plateforme MOABI recherche un.e ingénieur.e en bioinformatique, dont les missions principales seront les suivantes :

- Mettre en place des solutions d'analyse de données pour les cytogénéticiens de l'AP-HP

- Développer une base de données de variants structuraux (SV) à l'échelle de l'AP-HP

- Mettre en place et suivre le cycle de vie des données de génétiques
Profil recherché
Idéalement, vous avez ...
- Ingénieur(e) A+ et/ou PhD et/ou MD (Bioinformatique, Mathématiques, Biostatistique, Informatique)

Vous maîtrisez :
- Excellente connaissance d'un langage de script (Python, Bash)
- Excellente connaissance de R
- Excellente connaissance en gestion de données (data management)
- Expérience en analyses de données cytogénétiques
- Maîtrise de l'environnement Linux/Unix

Et humainement ? vous êtes ...
- Excellentes qualités relationnelles et organisationnelles
- Excellent esprit d'équipe et sens relationnel
- Excellentes qualités de communication
- Autonomie, rigueur, méthode
- Capacité de travail très importante, associée à un fort dynamisme.
- Curiosité et capacité d'adaptation et d'anticipation
- Fort intérêt pour le domaine des sciences biologiques et/ou médicales.
- Adhésion aux valeurs du service public et intérêt prononcé pour le domaine de la santé
- Adhésion aux valeurs de partage de connaissances et de compétences
Schéma horaireJourTemps de travailAdministratif - ForfaitHoraires de travailForfait jours - 25 jours de congés et 19 jours de RTTTélétravailOuiVos avantages à l'AP-HP- Possibilité de télétravail si le poste le permet ; - Remboursement partiel des transports en commun (75%) et/ou forfait mobilité ; - Accès au restaurant du personnel à tarifs avantageux ; - Un centre formation et de développement des compétences interne pour les formations management, les renforcement Métiers... ; - 19 jours de RTT, en plus des 25 jours de congés ; - Une offre de sorties culturelles, de voyages, de centres de vacances pour les titulaires et CDD sur poste permanent (AGOSPAP), des réductions et des bons plans (HOPTISOINS) ; - Pour les enfants, crèches internes, voyages culturels, séjours linguistiques et possibilité de bénéficier du supplément familial de traitement.
Description de l'hôpitalL'Assistance publique-Hôpitaux de Paris (AP-HP) est un centre hospitalier universitaire à dimension européenne mondialement reconnu. Ses 38 hôpitaux accueillent chaque année 10 millions de personnes malades : en consultation, en urgence, lors d'hospitalisations programmées ou en hospitalisation à domicile. Elle assure un service public de santé pour tous, 24h/24, et c'est pour elle à la fois un devoir et une fierté. L'AP-HP est le premier employeur d'Ile-de-France : 100 000 personnes - médecins, chercheurs, paramédicaux, personnels administratifs et ouvriers - y travaillent. Au coeur de l'Institution, le Siège de l'AP-HP rassemble sous un même périmètre les directions fonctionnelles et les établissements qui lui sont rattachés : CFDC (Centres de Formation et de Développement des Compétences), ACHAT (Achat Centraux Hôteliers Alimentaires et Techniques), DRCI (Département de la Recherche Clinique et de l'Innovation) et DSN (Direction des Services numériques). Avec ses 4000 collaborateurs, le Siège assure un rôle d'expert, de pilote et de coordinateur pour l'ensemble des hôpitaux. Engagée dans des projets novateurs et stratégiques au service des patients, l'AP-HP recherche aujourd'hui de nouveaux talents pour mener à bien sa mission. Vous êtes l'un d'eux ? Venez nous rejoindre ! Référence de l'offre2025-17729