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Ingénieur·e en Calcul Scientifique H/F Inserm Ciml

Marseille 9e - 13

CDD

Résumé de l'offre

2 494,30 € / mois
Bac +2
Bac +3, Bac +4
Bac +5
Service public des collectivités territoriales
Exp. - 1 an
Exp. 1 à 7 ans
Exp. + 7 ans

Les missions du poste

Le projet consiste à comprendre le rôle des cellules localisées à la surface du cerveau (cellules méningées) dans la protection du cerveau (neuroinfection) et la croissance/fonction du cerveau (neurocognition et maladie neurodevelopmentale). Nous combinons des data single cell RNAseq publiques et de l'équipe (cellules méningées et cérérales) pour comprendre leurs pathways d'activation, leurs interactions potentielles, et leur lien avec des pathologies connues (susceptibilité aux infections, autisme, épilepsie, migraine, etc.) Vous aurez la charge des analyses de données de transcriptomes en Singlecell RNA-seq, bulk RNAseq et spatial transcriptomique en coordination avec le CB2M (Computational Biology, Biostatistics and Modeling) du CIML. Vous devrez établir des protocoles d'analyse adaptés, produire des rapports d'analyse clairs et détaillés et les communiquer à votre équipe.

Activités principales
- Intégration au projet de recherche cité, assimilation des questions biologiques posées et mise au point un plan d'analyse bio-informatique adapté.
- Analyse des données Single-Cell RNA-seq et bulk RNAseq du projet (Analyse en réduction de dimensionnalité (ACP, t-SNE), expression différentielle, enrichissement fonctionnel, étude d'hétérogénéité cellulaire, dynamique, cell-cell communication...).
- Communication scientifique interne et externe. Mise en forme des résultats pour publications scientifiques.

Activités associées
- Communication scientifique interne et externe.
- Participation aux lab meeting de son équipe
- Participation aux rencontres et aux échanges de la communauté des bioinformaticiens du centre.

Le profil recherché

Experience : Débutant accepté

Compétences : Analyser, exploiter, structurer des données, Déterminer et développer les méthodes de recherche, de recueil et d'analyse de données, Relever, contrôler, ajuster des mesures et dosages

Langues : Anglais souhaité

Qualification : Employé qualifié

Secteur d'activité : Recherche-développement en autres sciences physiques et naturelles

Liste des qualités professionnelles :
Avoir l'esprit d'équipe : Capacité à travailler et à se coordonner avec les autres au sein de l'entreprise pour réaliser les objectifs fixés.
Organiser son travail selon les priorités et les objectifs : Capacité à planifier, prioriser, anticiper des actions, en tenant compte des moyens, des ressources, des objectifs et du calendrier pour les réaliser.
Faire preuve de rigueur et de précision : Capacité à réaliser des tâches en suivant avec exactitude les règles, les procédures, les instructions qui ont été fournies, sans réaliser d'erreur et à transmettre clairement des informations. Se montrer ponctuel et respectueux des règles de savoir-vivre usuelles.

Bienvenue chez Inserm Ciml

Créé en 1964, l Inserm est un établissement public à caractère scientifique et technologique, placé sous la double tutelle du ministère de la Santé et du ministère de la Recherche. Dédié à la recherche biologique, médicale et à la santé humaine, il se positionne sur l ensemble du parcours allant du laboratoire de recherche au lit du patient. Sur la scène internationale, il est le partenaire des plus grandes institutions engagées dans les défis et progrès scientifiques de ces domaines.

Ingénieur·e en Calcul Scientifique H/F

Inserm Ciml

Marseille 9e - 13
CDD

Publiée le 20/08/2025 - Réf : 196RXDN

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CDI

CDD

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