Postdoc en Biologie Moléculaire et Biochimie Biologie des Arn et Protéines H/F CNRS

Détail du poste

Cette étude sur le contrôle de qualité des ARNm par la traduction chez S. cerevisiae fera appel à des approches de biologie moléculaire et de biochimie dédiées à l'analyse d'ARN et de protéines (ex : construction de plasmides, northern et western blots, constructions de protéines taguées, fusions de protéines, immuno-précipitations) et de génétique de la levure (ex : culture, sélection, transformation et constructions de souches mutantes par croisement, PCR ou CrispR), des approches protéomiques et de séquençage d'ARN seront envisagées.
Activités
L'ARN messager, élément central dans la transmission de l'information génétique, voit son intégrité en permanence menacée par divers phénomènes liés, par exemple, à des défauts de la transcription, de maturation de l'ARN ou liés à diverses attaques ribonucléolytiques et chimiques que l'on retrouve dans certains contextes de stress, de senescence ou de maladies neurodégénératives. Ces défauts conduisent au blocage de la traduction, provoquent la collision importante des ribosomes qui, une fois détectée, déclenche des voies de surveillance comme celles du No-Go Decay (NGD) et du Non-Stop Decay (NSD), deux voies assurant la dégradation rapide des ARNm défectueux et des peptides naissants (produits d'arrêt nommés ici « Arrest Peptide » (AP)). De manière remarquable, le contrôle de la qualité des ARN messagers, premièrement décrit chez la levure, s'avère conservé chez tous les eucaryotes jusqu'alors étudiés.
Nous poursuivrons donc l'étude en cours dans le laboratoire sur les mécanismes activés lorsque les ribosomes sont bloqués au sein de la séquence codante. Il est proposé que ces ARNm soient principalement dégradés par un decapping en 5' suivi d'une dégradation exonucléolytique 5'-3' par l'exoribonucléase Xrn1. La manière dont les processus de dégradation des peptides (AP) et des ARN sont coordonnés reste cependant mal comprise. Nos résultats actuels permettent de proposer un modèle dans lequel le facteur d'activation du decapping Pat1, conservé chez les eucaryotes, jouerait un rôle important dans la coordination de ce contrôle qualité associé aux ribosomes. Cependant lorsque ce processus est absent, deux endocnucléases potentielles interviendraient de manière couplée et interféraient avec la dissociation normale des ribosomes et affecteraient le processus canonique de dégradation de l'AP. Le rôle de ces deux endoribonucléases devient particulièrement intéressant à étudier comme système de secours dans ces voies de surveillance.

Compétences
- Très bonnes connaissances pratiques en biologie moléculaire et microbiologie
- Très bonne connaissance en génétique de la levure
- Très bonnes connaissances expérimentales de la biologie des ARN et des protéines
- Souci de la rigueur
- Curiosité scientifique, esprit d'innovation, goût pour le travail expérimental
- Autonomie et esprit d'organisation
- Aptitude à travailler en équipe et à s'inscrire dans des projets collectifs
- Bonnes bases en anglais écrit et parlé
- Savoir utiliser des logiciels dédiés à l'analyse des données expérimentales.
- Savoir appliquer les réglementations en matière d'hygiène et sécurité.

Contexte de travail

Le poste est situé à l'Institut de Biologie Physico-Chimique, Paris. L'équipe Régulation Fonctionnelle et Surveillance de l'ARN, dans laquelle le poste est ouvert, fait partie de l'unité UMR8226, Laboratoire de Biologie Moléculaire et Cellulaire des Eucaryotes. L'équipe est composée d'1 chercheur, de 2 enseignantes-chercheuses, d'une Post-Doctorante, un doctorant et deux assistantes ingénieures. L'agent sera placé sous la responsabilité du chef d'équipe.
Contraintes et risques

Pas de contraintes et risques particuliers