Chercheur Bioinformaticien H/F CNRS

Détail du poste

L'agent sera recruté comme chercheur contractuel. Il sera en charge de l'analyse
bioinformatique de 3 essais cliniques en oncologie. Dans ces 3 essais thérapeutiques, les analyses bioinformatiques auront pour objectifs d'identifier des biomarqueurs de réponses et/ou d'efficacités (accès aux échantillon avant/après traitement et statut de réponse du patient).
Activités
- Analyse de données RNAseq issues de cohortes de patients issus d'essais cliniques, incluant des expériences de single-cell RNAseq et d'analyses transcriptomiques spatiales.
- Concevoir et élaborer la structure de bases de données et de systèmes d'information permettant de collecter, structurer, stocker et mettre en relation les données
- Collaboration étroite avec les biologistes et cliniciens pour interpréter les résultats et participer à la rédaction des rapports, communications orales et publications (Diffuser et valoriser les résultats).
- Concevoir les modèles mathématiques adaptés
- Veille technologique sur les méthodes d'analyse OMICS

Compétences
- Doctorat en bioinformatique, biologie computationnelle, biostatistiques ou domaine équivalent.
- Maîtrise des langages R, Python et bash pour le traitement et l'analyse de données transcriptomiques.
- Connaissance des méthodes d'analyse RNAseq, single-cell RNAseq et analyses transcriptomiques spatiales.
- Bonnes capacités de communication orale et écrite, avec une aisance pour présenter des résultats en congrès et rédiger des publications scientifiques.
- Capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire, rigueur et autonomie.
Contexte de travail

Le Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (CRCL) est un centre de renommée internationale dédié à la recherche innovante en oncologie. Composé de plus de 600 chercheurs et cliniciens, le CRCL se consacre à comprendre les mécanismes du cancer et à développer de nouvelles stratégies thérapeutiques.
Vous travaillerez dans un environnement scientifique international dédié à la recherche sur le cancer, grâce à la présence des 24 équipes de recherche et des 12 plateformes technologiques présentes sur le site.
Vous serez intégré(e) dans notre équipe de recherche, intitulée "Apoptose, Cancer et Développement" qui est constituée d'une vingtaine de membres.