Ingénieur·e Biologiste en Traitement de Données H/F CNRS

Détail du poste

Le (la) candidat(e) retenu(e) aura pour mission d'apporter un soutien en analyse d'images confocales et modélisation mathématique dans le cadre d'un programme de recherche financé par l'ANR et visant à comprendre les premières étapes de la fécondation chez la plante Arabidopsis thaliana. Cette mission, est à la frontière entre la biologie et les mathématiques ; le (la) candidat(e) sera co-encadré(e) par une biologiste et un informaticien.
Activités
Analyse d'images confocales afin d'en extraire la surface 3D des cellules de l'exrémité de l'organde reproducteur femelle (papilles stigmatiques) et les trajectoires des tubes polliniques (véhiculant les gamètes mâles).
- Utilisation des données extraites pour calculer les paramètres essentiels du modèle mathématiques pré-existant.
- Comparaison des trajets des tubes polliniques réels et simulés. Amélioration du modèle en cas de divergences.
- Veille scientifique sur les méthodes du domaine
Compétences
Programmation Python pour l'analyse et la visualisation des données.
-Connaissance de la géométrie 3D et/ou en biophysique. Intérêt pour travailler dans un environnement interdisciplinaire.
- Capable de rendre-compte aux responsables scientifiques et présenter ses résultats devant les équipes d'accueil.
- Maîtrise de l'anglais scientifique et technique.
- Capacités organisationnelles, autonomie, rigueur et adaptabilité.
- Esprit d'équipe.
Contexte de travail

Le Laboratoire Reproduction et Développement des Plantes (RDP) de Lyon mène une activité de recherche fondamentale visant à une compréhension quantitative multi-échelle du développement et de l'évolution des structures reproductives des plantes. Pour cela, le laboratoire RDP s'appuie sur des approches de biologie du développement classiques et sur une expertise internationalement reconnue en biologie des systèmes utilisant approches multidisciplinaires pour aborder les bases moléculaires et physiques de la morphogenèse des plantes.
Situé sur le campus Monod de l'ENS de Lyon, le laboratoire RDP rassemble 120 collaborateurs et collaboratrices répartis au sein de 9 équipes de recherche. Nous disposons de toutes les ressources et infrastructures nécessaires pour mener à bien nos missions de recherche. Dans notre environnement dynamique et collaboratif, la créativité est encouragée, offrant ainsi à chacun l'opportunité de contribuer à des projets de recherche novateurs.
Nos petits plus :
- Un environnement de travail stimulant aux contacts des personnels de la recherche.
- Des formations adaptées pour vous accompagner
- Le remboursement partiel des titres de transport (75%) + forfait mobilité durable pouvant atteindre 300€ / an
- Un site accessible en transport en commun + parking privé
- Participation financière au frais de mutuelle
- Accès au Comité d'Action Economique et Sociale du CNRS à partir de 6 mois d'ancienneté