Ingénieur d'Étude Chemoinformatique et Chimiothécaire H/F Université Grenoble Alpes
Gières - 38 Fonctionnaire- 29 544 € / an
- Bac +5
- Service public d'état
Détail du poste
Missions principales :
Vous aurez comme mission principale de mettre en oeuvre et d'exploiter des outils de chimio-informatique, tant pour les projets scientifiques menés au sein de l'unité que pour la gestion et la valorisation de la chimiothèque, à l'échelle locale et nationale.
Activités :
Exploitation des données de la recherche :
- Explorer la structure 3D des macromolécules (protéines, acides nucléiques) en étudiant leurs motifs évolutifs sur la séquence protéique à l'aide des techniques d'apprentissages profondes (modèles de langage, diffusion...)
- Utiliser des modèles d'apprentissage profond pour l'étude des interactions moléculaires, des approches thérapeutiques (créer des nouvelles candidatures médicamenteuses en se basant sur la structure et les signaux physico-chimiques des sites d'interaction de la protéine) et entre biomacromolécules pour des approches analytiques
- Construire des modèles d'étude par l'apprentissage automatique (machine learning)-apprentissage profonde (Deep learning) avec préparation/nettoyage des données moléculaires
- Analyser des données par des méthodes statistiques : SAR, QSAR, QSPR, calcul de descripteurs, analyse de diversité, recherche d'analogues, élaboration de bibliothèques virtuelles
Modélisation moléculaire :
- Effectuer des docking et criblages virtuels : aspect structural des biomacromolécules (protéines, acides nucléiques etc.) et des petits ligands
Chimiothèque :
- Assurer la gestion et la mise en valeur des données structurales et biologiques
- Assurer, avec l'appui de technicien, la collecte et la gestion des échantillons
- Participer à la gestion administrative de la Chimiothèque de l'ICMG et aux activités de la Chimiothèque Nationale (ChemBioFrance)
Activités secondaires :
- Apporter un soutien à la gestion des ressources informatiques communes de l'unité
Détails rémunération :
A partir de 1944€ mensuel brut et en fonction de l'expérience.
Vous percevrez en plus de votre salaire un régime indemnitaire d'un montant mensuel brut de 518 €.
Le profil recherché
- Savoir analyser des données et exploiter des bases de données scientifiques
- Pouvoir mener à bien des constructions et entrainements de modèles de Deep learning (comprendre l'architecture des réseaux de neurones artificiels, packages Tensorflow, PyTorch, Keras...,)
- Connaître la mécanique moléculaire, les descripteurs moléculaires et savoir traduire ces descripteurs en termes pharmacocinétiques et pharmacodynamiques
- Avoir une communication interdisciplinaire (entre les experts de Deep learning et chimie/biologie) et participer à la gestion de projets scientifiques
- Connaitre les langages de programmation : Bash, Python et/ou R, Langages de requête de type SQL, HTML, PHP (+CakePHP), perl, subversion (optionnel)
- Avoir des connaissances pratiques sur des paquets et des logiciels chemoinformatiques et moléculaires (RDkit, Data Warriors, Chemdraw, Pymol...)
- Savoir rédiger des documentations techniques (procédures, modes opératoires, comptes rendus de réunion), rapports scientifiques et participer à la rédaction de publications
- Connaitre l'administration de système Linux (installation, mises à jour, gestion de services, filtrage réseau)
Infos complémentaires
29 544 € brut/par an
- Gières - 38
- Fonctionnaire
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