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Assistant·e Ingénieur·e en Chimie Analytique H/F Ecole Nationale Veterinaire Agroaliment

Nantes - 44

CDD

Résumé de l'offre

2 008,69 - 2 118,07 € / mois
Bac +2
Bac +3, Bac +4
Bac +5
Service public des collectivités territoriales
Exp. - 1 an
Exp. 1 à 7 ans
Exp. + 7 ans

Les missions du poste

Le LABERCA (LABoratoire d'Étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments) est une unité de recherche de l'École Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'Alimentation (Oniris VetAgroBio Nantes).
Le LABERCA a déposé le projet Steronline, dans le cadre de l'appel à projet de la Fondation pour la Recherche sur l'Endométriose. Cette pathologie est une maladie inflammatoire systémique, dépendante des hormones stéroïdiennes et caractérisée par la croissance d'un tissu ressemblant à l'endomètre en dehors de l'utérus.
L'objectif principal du projet sera de développer une stratégie analytique novatrice basée sur la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse qui permettra de faire évoluer la connaissance de la physiopathologie de l'endométriose et de favoriser l'identification de biomarqueurs diagnostiques.
Ce projet sera mené en collaboration avec trois équipes du LABERCA, qui allieront ainsi leurs compétences en métabolomique (plateforme MELISA), chimie analytique (cellule ATI) et épidémiologie (Unité de Mixte de Recherche en santé).

Activités principales :
- Participer au développement d'une méthode rapide d'analyse de stéroïdes déjà éprouvée à laquelle l'étude viendra ajouter plusieurs stéroïdes reconnus comme pertinents dans le diagnostic de l'endométriose. L'intérêt : élargir la couverture analytique de quelques hormones à un panel le plus large possible selon les technologies de haut débit actuelles. Cette méthodologie sera adaptée à deux types d'échantillons ; le sérum et l'urine, afin de favoriser le diagnostic non invasif.
- Participer à l'optimisation du processus d'analyse par approche non ciblée, et plus particulièrement à l'étape de traitement des données.
- Appliquer les stratégies analytiques développées sur des échantillons provenant d'une étude clinique. Cette étude comportera des échantillons de femmes atteintes ou non d'endométriose sévère afin de mettre en évidence les différences entre les différents groupes de femmes et d'investiguer des mécanismes de la maladie.
Les grandes étapes de ce projet sont :
- Prise en main de l'instrumentation LC-(ESI-)-HRMS
- Prise en main des outils de retraitement bio-informatiques
- Consolidation de méthodes rapides (définition des paramètres cibles, validation analytique), en utilisant deux matrices complémentaires : l'urine et le sérum.
- Préparation des échantillons
- Mise en place de la méthode de retraitement ciblée sur les données
- Mise en place d'un processus d'analyse non ciblée d'échantillons (urine et sérum)
- Préparation des échantillons
- Analyse des échantillons par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse (Q-Exactive)
- Pré-traitement des données via un ou plusieurs algorithmes / scripts sous environnement R (déjà en place ou ayant fait l'objet d'adaptations contextuelles) et sous Galaxy - workflow4metabolomics,
- Génération d'analyses statistiques uni- (ANOVA, tests t, Mann-Whitney,.) et multi-variées (classification, ACP, PLS, OPLS, PLS-DA.) permettant une première synthèse, visualisation, et interprétation des données
- Annotation des métabolites via l'exploitation d'une base de données interne
- Application à des échantillons biologiques provenant d'une étude clinique de femmes étant atteinte ou non d'endométriose
- Communication autour du projet
Le/la candidat(e) recruté(e) évoluera au sein du réseau CORSAIRE, ensemble de plateaux/plateformes spécialisées en profilage métabolique et métabolomique du Grand Ouest, et de l'infrastructure national de métabolomique et fluxomique - MetaboHUB dont la plateforme MELISA est un acteur.

Le profil recherché

Experience : Débutant accepté

Qualification : Cadre

Secteur d'activité : Enseignement supérieur

Bienvenue chez Ecole Nationale Veterinaire Agroaliment

Oniris, établissement public d'enseignement supérieur et de recherche du Ministère de l'Agriculture, de la Souveraineté et de l'Alimentation (MASA) a pour objectif principal de former des techniciens et des ingénieurs en agroalimentaire et des docteurs vétérinaires.
L'établissement compte environ 550 personnes et 1100 étudiants, sur deux campus, le campus vétérinaire à la Chantrerie et le campus sciences de l'alimentation à la Géraudière.

Assistant·e Ingénieur·e en Chimie Analytique H/F

Ecole Nationale Veterinaire Agroaliment

Nantes - 44
CDD

Publiée le 13/06/2025 - Réf : 193SSRM

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