Ingénieur de Recherche en Bioinformatique Analyse des Données Omiques H/F Institut Curie

Détail du poste

Laboratoire

Dynamique de la chromatine

Publications récentes :
- Renaud-Pageot, C. & Almouzni, G. Tipping the balance in histone supply puts genome stability at stake. Embo j 43, 2091-2093 (2024).
- Mendiratta, S. et al. Regulation of replicative histone RNA metabolism by the histone chaperone ASF1. Mol Cell 84, 791-801.e6 (2024).
- Karagyozova, T. & Almouzni, G. Replicating chromatin in the nucleus : A histone variant perspective. Curr Opin Cell Biol 89, 102397 (2024).
- Gatto, A., Forest, A., Quivy, J.-P. & Almouzni, G. HIRA-dependent boundaries between H3 variants shape early replication in mammals. Molecular Cell (2022).
- Delaney, K., Weiss, N. & Almouzni, G. The cell-cycle choreography of H3 variants shapes the genome. Mol Cell 83, 3773-3786 (2023).

Projet

Le/La candidat(e) contribuera à l'analyse bioinformatique des données omiques à haut débit générées dans le cadre de multiples projets de recherche en biologie moléculaire et cellulaire au sein du laboratoire. Cela comprend le traitement, et l'interprétation d'ensembles de données omiques (notamment RNA-seq, ChIP-seq et ATAC-seq) en étroite collaboration avec les équipes expérimentales.

Les responsabilités supplémentaires incluent :
- Concevoir et mettre en oeuvre des pipelines d'analyse adaptés à des types de données et des hypothèses biologiques spécifiques;
- Produire des rapports et des synthèses de données adaptés à l'interprétation par les biologistes;
- Contribuer à la diffusion des résultats par le biais de publications, de la génération de figures et du dépôt de données.

Formation et compétences

Le candidat doit être titulaire d'un doctorat.

Il doit justifier d'au moins 5 ans d'expérience en analyse bioinformatique.

Il doit être capable d'explorer des données issues de diverses bases de données (génomique, protéomique, pathologies, évolution des organismes) et de combiner des bases de données disponibles et des données omiques produites au sein de l'équipe d'accueil afin de générer des ensembles de données spécifiquement dédiés aux projets de recherche de l'équipe

Il doit posséder une expertise et une expérience en analyse multiomique à partir de données de cellules individuelles et en population. Cela inclut :
- Analyse de l'expression génique, y compris l'identification des transcrits et l'analyse de l'épissage.
- Analyse ChIP-Seq.
- Organisation de la chromatine (ATAc-Seq, sensibilité aux nucléases, Hi-C).

Aptitudes requises

Compréhension approfondie des processus biologiques associés à l'épigénétique, à l'organisation et à la dynamique de la chromatine, ainsi qu'à l'organisation spatiale du génome dans les cellules de mammifères.

Le/La candidat(e) devra être autonome et en contact permanent avec les biologistes de l'équipe pour rendre compte et discuter des résultats

Toutes nos opportunités sont ouvertes à des personnes en situation de handicap.

Informations sur le contrat

Type de contrat : CDD

Date de démarrage : poste disponible

Durée du contrat : 9 mois

Temps de travail : Temps complet

Rémunération : selon les grilles en vigueur

Avantages : Restauration collective, prise en charge du titre de transport annuel à 70%, mutuelle d'entreprise

Localisation du poste : Paris

Référence : ne pas compléter

Contact

Pour postuler, merci d'envoyer CV et lettre de motivation

Date de parution de l'offre : 11/06/2025

Date limite des candidatures : jusqu'à ce que le poste soit pourvu.

L'Institut Curie est un employeur inclusif respectant l'égalité des chances.

Il s'engage également à appliquer des normes exigeantes en matière d'intégrité de la recherche.