Ingénieur Bioinformaticien - Analyse Computationnelle des Protéin H/F Pôle Emploi
Gif-sur-Yvette - 91 CDD- 2 540 - 3 281 € / mois
- Bac +5
- Service public des collectivités territoriales
- Exp. - 1 an
- Exp. 1 à 7 ans
- Exp. + 7 ans
Détail du poste
Missions
L'ingénieur.e développera, en Julia et Python, un pipeline modulaire pour analyser et scorer les protéines intrinsèquement désordonnées (IDPs), en intégrant des méthodes évolutives et de deep-learning afin d'identifier les conformations et interactions biologiquement pertinentes ; il/elle assurera également la gestion complète des données générées (collecte, structuration FAIR, documentation) et publiera le code en open-source.
Activités
- Développer et maintenir un code Julia/Python avec tests unitaires et intégration continue ;
- Implémenter des modèles de deep-learning sur graphes pour le scoring des IDPs ;
- Constituer et documenter des jeux de données conformes aux principes FAIR ;
- Exploiter les clusters CPU/GPU de l'institut et les infrastructures nationales HPC ;
- Rédiger documentation, rapports techniques et publications.
Compétences
- Solide pratique de Julia (ou forte motivation à l'acquérir) et bonne maîtrise de Python ;
- Développement logiciel scientifique : Git, tests, CI, conteneurs ;
- Connaissances en bioinformatique structurale et modélisation ;
- Autonomie, sens de l'organisation, travail en équipe ;
- Anglais scientifique niveau B1-B2 (CECRL)
Contexte de travail
Le poste est intégré à l'équipe AMIG - Assemblages Moléculaires et Intégrité du Génome - de l'I2BC (Institute for Integrative Biology of the Cell), qui comprend une composante wet-lab et une composante dry-lab ; l'ingénieur.e exercera dans cette dernière. L'environnement dispose de clusters CPU/GPU locaux ainsi que d'un accès aux supercalculateurs nationaux. La personne recrutée évoluera dans un écosystème interdisciplinaire à l'interface de la biologie structurale, de l'informatique et de l'IA, en interaction étroite avec les partenaires du réseau COST ML4NGP. Ses travaux contribueront directement aux objectifs scientifiques du projet ANR SPPICES (Scoring and Predicting Protein Interactions and Conformations based on Evolutionary Signals), visant à éclairer la dynamique conformationnelle et les interactions protéiques impliquant des régions désordonnées.
L'I2BC est une très grande unité mixte de recherche CNRS, CEA et Université Paris Saclay. Le poste est basé sur le site de Gif-sur-Yvette.
Le profil recherché
Experience : Débutant accepté
Compétences : Langages de programmation informatique, Collecter et analyser des données, des informations, Rendre compte de son activité
Langues : Anglais souhaité
Qualification : Employé qualifié
Secteur d'activité : Recherche-développement en sciences humaines et sociales
Liste des qualités professionnelles :
Faire preuve d'autonomie : Capacité à prendre en charge son activité sans devoir être encadré de façon continue (le cas échéant, à solliciter les autres acteurs de l'entreprise).
Organiser son travail selon les priorités et les objectifs : Capacité à planifier, prioriser, anticiper des actions, en tenant compte des moyens, des ressources, des objectifs et du calendrier pour les réaliser.
Travailler en équipe : Capacité à travailler et à se coordonner avec les autres au sein de l'entreprise pour réaliser les objectifs fixés.
- Gif-sur-Yvette - 91
- CDD
Créez une alerte
Pour être informé rapidement des nouvelles offres, merci de préciser les critères :
Finalisez votre candidature
sur le site du partenaire
Créez votre compte pour postuler
sur le site du partenaire !
sur le site du partenaire
sur le site du partenaire !
Ces offres pourraient aussi
vous intéresser
Recherches similaires
- Job Bio-informaticien
- Job Logistique
- Job Étampes
- Job Dourdan
- Job Corbeil-Essonnes
- Job Massy
- Job Montgeron
- Job Brétigny-sur-Orge
- Job Les Ulis
- Job Draveil
- Job Milly-la-Forêt
- Job Yerres
- Job Cariste
- Job Préparateur de commande
- Job Manutentionnaire
- Job Magasinier
- Job Développeur
- Entreprises Logistique
- Entreprises Bio-informaticien
- Entreprises Gif-sur-Yvette
- Job Fonction publique
- Job Collectivités
- Job Fonction publique territoriale
- Job Débutant
- Job Ressources
{{title}}
{{message}}
{{linkLabel}}