Ingénieur·e Biologiste en Traitement de Données H/F

Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (Inserm)

La personne recrutée travaillera au sein de l'Equipe de Recherche Labellisée Inserm et du « Hub BIO-COMPUTING ». La mission principale de l'agent sera de participer au développement de méthodologies adaptées à la recherche du LBMC, en particulier en lien avec le traitement et l'analyse de données omiques, sur des thématiques portées par les équipes du laboratoire incluant l'organisation 3D du génome, l'épigénétique et le métabolisme des ARNs. L'ingénieur-e accompagnera les chercheurs tout au long du processus de production et d'analyse de données (traitement et analyse, modélisation, stockage et data management) ainsi que les personnels du LBMC afin qu'ils puissent améliorer leurs bonnes pratiques liées au bio-computing.

· Mettre en place des procédures standardisées de traitement et d'analyse des données omiques depuis leur production jusqu'à leur dépôt sur les entrepôts de données (ex : NCBI/EBI), en utilisant des infrastructures de calculs et stockage adaptées (ex : cluster de calcul).

· Aider à l'implémentation de développements méthodologiques pour traitement de données biologiques (ex : omiques, imagerie, modélisation).

· Intégrer des données multi-omiques (transcriptomique, translatomique, protéomique) pour l'étude de la régulation de l'expression des gènes.

· Assurer le respect des normes qualité et des réglementations en vigueur pour garantir la reproductibilité des analyses effectuées et aider les différentes équipes à améliorer leurs bonnes pratiques (ex : codage, développement logiciel, conteneurisation).

· Participer à la formation interne des membres du laboratoire à ces nouvelles méthodologies et à l'activité du réseau bio-informatique local en participant à des formations.

· Accompagner les équipes de recherche : conseils méthodologiques, assistance, formation et former les chercheurs aux procédures existantes et assurer le support technique et la formation aux outils développés.

· Participer à des co-encadrements d'étudiants sur des projets de recherche en collaboration avec des bio-informaticiens ou avec des biologistes.