Ingénieur Biologiste en Traitement de Données H/F Inrae
Saumane-de-Vaucluse - 84 CDD- Bac +3, Bac +4
- Bac +5
- Service public autres
Détail du poste
Dans un contexte de réduction du parapluie phytosanitaire imposé par l'union européenne, il devient urgent d'identifier des résistances ou tolérances aux différents bioagresseurs dommageables à la production fruitière, des variétés mieux adaptées à leur environnement et plus résilientes pour construire des vergers plus durables. L'équipe DADI coordonne deux projets dans lesquels vous serez directement impliqué-e :
- Le projet CASDAR RésiDiv. Il vise à identifier les différentes composantes de la résilience des vergers fruitiers en conditions de basse protection phytosanitaire pour aider la création variétale. Il ambitionne également d'identifier des individus résilients en conditions de zéro pesticides' qui permettront de construire les variétés nécessaires à des vergers plus durables.
- Le projet européen InnOBreed. Il est dédié aux espèces de fruits à pépins et à noyau mais aussi à la vigne et aux agrumes. Il vise à produire un état des lieux des besoins des filières fruitières pour développer, tester, valider et implémenter des solutions innovantes technologiques et socio-économiques en agriculture biologique. Il a pour vocation d'identifier et introduire du matériel d'intérêt dans les schémas de création variétale qui seront mieux adaptés à la production fruitière biologique en Europe. https://innobreed.eu
Les travaux menés dans le cadre de ces projets reposent sur deux dispositifs expérimentaux chez l'abricotier et le pêcher appelés «core-collections», qui sont constitués d'un assemblage d'accessions (150 accessions et 206 individus respectivement) et dont les données de génotypage sont disponibles.
- Vous exercerez vos missions d'ingénieur·e d'études au sein de l'équipe Prunus (11 permanents) du GAFL
- Vous serez encadré·e par les responsables des projets de recherche (2 chercheurs et un ingénieur)
- Vous serez mobilisé·e surla collecte, le stockage, la gestion des données sur le serveur INRAE et la mise en forme des données de phénotypage pour la préparation des analyses statistiques
- Vous prendrez en charge le traitement des données dans le langage R pour mettre en oeuvre des statistiques descriptives et des modèles statistiques pour l'étude de la relation génotype-phénotype, notamment via la génétique d'association (GWAS)
- Vous serez en lien avec l'équipe informatique, bio-analyses et biostatistiques de l'unité
- Vous participerez ponctuellement à la caractérisation phénotypique des core collections en vergers pour venir en appui aux techniciens de l'équipe
- Vous rendrez compte régulièrement de l'avancée de vos résultats aux responsables de projets
- Vous participerez aux réunions de projets et vous serez amené·e à présenter vos résultats
- Vous serez impliqué·e dans la logistique des projets : organisation des meetings, reporting des réunions, interactions avec les partenaires, compilation des documents, rédaction des rapports...
- Vous participerez aux réunions bimensuelles d'équipe
Le profil recherché
Licence ou Master dans le domaine de formation souhaité : statistiques, bio-statistiques, bio-analyses, bio-informatique, génétique quantitative.
- Connaissances de bases requises en biologie et production végétale
Rigueur et organisation pour la manipulation et l'analyse de
- Données
- Traitement des données
- Faculté à travailler en équipe et de manière autonome
- Interagir au quotidien avec les responsables des projets
- Interagir avec de multiples interlocuteurs de diverses disciplines (généticiens, bio-informaticiens, chercheurs, ingénieurs et techniciens) et horizons (instituts techniques et sélectionneurs, partenaires des projets français et européens)
- Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats
- Transmettre des résultats sous forme de compte-rendu et de présentation orale
- Anglais écrit et parlé nécessaire
- Saumane-de-Vaucluse - 84
- CDD
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