Ingénieur d'Études en Bioinformatique H/F Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (Inserm)
Paris 13e - 75 Fonctionnaire- Bac +5
- Service public hospitalier
Détail du poste
Mission principale :
La personne recrutée aura pour mission l'analyse et l'intégration bioinformatiques de données omiques (bulk RNAseq, single nuclei RNAseq, spatial transcriptomic, methylome) obtenus à partir d'échantillons tumoraux et de modèles tumoraux humains et murins. Elle travaillera en interaction avec l'investigateur principal, les bioinformaticiens senior et junior, les postdoctorantes, les ingénieures en biologie et les étudiant(e)s pour contribuer par son expertise bioinformatique aux projets de recherche de l'équipe.
Activités principales :
· Contrôle qualité, quantification de l'expression en bulk, cellule unique et transcriptomique spatiale, analyse de la variance, regroupement hiérarchique, analyse différentielle, annotation fonctionnelle, analyse récepteur-ligand
· Conception de signatures d'expression à partir de données en cellules uniques et appariemment avec les données transcriptomiques spatiales sans ou avec déconvolution
· Contrôle qualité et quantification de la méthylation; conception de signatures de régions différentiellement méthylées, corrélation avec l'expression et analyse de l'hétérogénéité intratumorale et intertumorale
Le profil recherché
Connaissances :
· Bases de la biologie moléculaire, niveau premier cycle
· Formation de second cycle en bioinformatique
· Structures de données et Algorithmes en Transcriptomiqu
· Clustering et Réduction de dimension
· Machine learning
Savoir-faire :
· Langage de programmation : Python, R
Afficher la suite
· Réalisation d'un projet de programmation en interaction avec les utilisateurs et avec adaptation du projet aux besoins et retours des utilisateurs
· Présentation et communication de l'avancée d'un projet
Aptitudes :
· Autonomie, organisation du temps de travail
· Travail en équipeavec les bioinformaticiens et non bioinformaticiens
· Curiosité avec recherche critique de ressources bibliograpiques et méthodologiques
- Paris 13e - 75
- Fonctionnaire
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