Ingénieur d'Études en Bioinformatique H/F CNRS

Détail du poste

Le candidat participera aux projets bioinformatiques développés au sein de l'équipe.
Il devra :
- Analyser et résoudre les problématiques bioinformatiques dans le cadre des programmes de recherche
- Concevoir, développer et déployer des outils bio-informatiques
- Réaliser la gestion et l'analyse des données « omiques »

Activités
Formaliser un problème scientifique en terme technique.
Assurer la veille technologique dans le domaine et tester de nouvelles approches.
Conseiller pour le choix de méthodologies lors de l'élaboration d'un projet scientifique, et dans leur mise en oeuvre.
Développer des outils de traitements automatisés de données biologiques et les appliquer dans le cadre de programme de recherche.
Rédiger des protocoles d'utilisation des outils et des méthodes mises en place.
Créer des bases de données permettant le stockage, la gestion et l'analyse des données produites par les projets d'étude des génomes, transcriptomes...
Assurer le transfert de connaissances et des savoir-faire (animation de réunions bio-informatiques, formations et/ou encadrement des scientifiques (partenaires en accueil, stagiaires et étudiants)).
Apporter une assistance et un support technique en bio-informatique aux membres de l'équipe

Compétences
Avoir des connaissances en biologie moléculaire et cellulaire et en physiologie du système neuromusculaire
Avoir des connaissances approfondies dans le domaine de la bio-analyse et la bio-informatique
Maitriser au moins un langage de programmation parmi Perl, Python, Java, R, PHP et des technologies Web (JQuery, JSON...).
Connaissance des problématiques liées aux Big Data.
Maitriser les systèmes d'exploitation Linux.
Posséder des qualités rédactionnelles et de communication.
Savoir gérer le stockage et la manipulation des données de grande dimension
Savoir formuler une problématique scientifique en termes techniques.
Maîtriser l'anglais

Contexte de travail

L'agent sera recruté dans l'équipe "environnement des cellules souches musculaires et homéostasie du muscle strié squelettique" dirigée par Bénédicte Chazaud à l'Institut NeuroMyoGène de Lyon (UCBL1, CNRS5261, INSERM1315). Les travaux de notre équipe visent à comprendre la régulation du tissu musculaire et des types cellulaires (cellules souches, cellules immunes, vaisseaux...) qui le composent dans des contextes physiologiques (e.g., exercice, blessure musculaire) et pathologiques (dystrophies musculaires, cachexie liée au cancer, choc septique...)