Ingénieur en Calcul Scientifique H/F CNRS

Ajuster et valider en temps différé les données BGC-Argo.
Activités
Réaliser le traitement des données en temps différé des données BGC-Argo (application des procédures de contrôle qualité, vérification, validation et soumission des données au centre de données opérationnel) ;
Assurer la maintenance des bases de données créées ;
Rédiger la documentation des données qualifiées afin d'assurer un suivi ;
Adapter les applications informatiques aux besoins du projet ;

Compétences
Mathématiques, statistiques ;
Des connaissances générales en biogéochimie marine sont les bienvenues ainsi que dans le domaine de la collecte des données océanographiques ;
Expertise en langages de programmation (R, Matlab, Shell, Python) ;
Recueil, analyse et traitement des données ;
Maîtrise de l'environnement Linux, Unix ;
Langue anglaise : B2 (cadre européen commun de référence pour les langues) .

Résultats attendus et contrôles

Capacité de traiter des bases de données volumineuses et hétérogènes ;
Savoir manipuler des fichiers NetCDFs serait un plus ;
Définir et calculer des indicateurs pour mesurer la performance et l'amélioration du contrôle qualité ;
Rédiger régulièrement des rapports synthétiques sur l'état de la base BGC-Argo ainsi que sur le contrôle de qualité ;
Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats ;
Interagir avec des scientifiques (biogéochimistes, chimistes, physiciens) et des informaticiens.
Capacité de traiter des bases de données volumineuses et hétérogènes ;
Savoir manipuler des fichiers NetCDFs serait un plus ;
Définir et calculer des indicateurs pour mesurer la performance et l'amélioration du contrôle qualité ;
Rédiger régulièrement des rapports synthétiques sur l'état de la base BGC-Argo ainsi que sur le contrôle de qualité ;
Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats ;
Interagir avec des scientifiques (biogéochimistes, chimistes, physiciens) et des informaticiens.

Contexte de travail

Le programme BGC-Argo (http://biogeochemical-argo.org/) est la composante biogéochimique du programme international OneArgo (http://www.argo.ucsd.edu/) initié en 1999 comme un projet pilote du programme de recherche pour le climat GOOS de la WMO (Organisation Mondiale de la Météorologie) et de l'IOC (Commission Océanographique Intergouvernementale). OneArgo est un réseau global de 4000 plateformes autonomes, déployées à l'échelle globale qui mesurent des paramètres océanographiques et les transmettent par transmission satellite. Les données OneArgo sont utilisées par une large communauté scientifique.

La composante biogéochimique BGC-Argo, bien que relativement récente, s'est toutefois exponentiellement développée au cours des dernières années. BGC-Argo représente désormais une des plus importantes bases de données existantes sur la biogéochimie océanique. Elle concerne 6 variables biogéochimiques internationalement identifiées : concentrations en chlorophylle-a (proxy de la biomasse phytoplanctonique), en particules et en nitrates, oxygène dissous, irradiance et pH.

L'Institut de la Mer de Villefranche, le Laboratoire d'Océanographie de Villefranche et l'OSU Ecce Terra (Sorbonne Université/CNRS), en partenariat avec le centre d'océanographie opérationnelle Coriolis, participent activement au niveau international à la mise en place du contrôle qualité et de l'ajustement des variables biogéochimiques acquises par les flotteurs BGC-Argo. L'ajustement et le contrôle qualité des données se déclinent en deux phases : une première série de tests automatiques (effectuée dans les 24h après la collecte des données, mode dit « en temps réel ») et une deuxième, qui implique une expertise scientifique (effectuée dans un intervalle de temps plus long, mode dit « en temps différé »). Ce poste s'inscrit dans le cadre de gestion de données du programme BGC-Argo, i.e. application des algorithmes d'ajustement et validation des données en temps différé.

Le travail se déroulera en collaboration avec les laboratoires et instituts européens impliqués dans le contrôle qualité des 6 variables BGC-Argo ainsi qu'avec les centres opérationnels européens du programme Argo/BGC-Argo (BODC, UK ; Coriolis, FR ; BSH, DE).
Le programme BGC-Argo (http://biogeochemical-argo.org/) est la composante biogéochimique du programme international OneArgo (http://www.argo.ucsd.edu/) initié en 1999 comme un projet pilote du programme de recherche pour le climat GOOS de la WMO (Organisation Mondiale de la Météorologie) et de l'IOC (Commission Océanographique Intergouvernementale). OneArgo est un réseau global de 4000 plateformes autonomes, déployées à l'échelle globale qui mesurent des paramètres océanographiques et les transmettent par transmission satellite. Les données OneArgo sont utilisées par une large communauté scientifique.

La composante biogéochimique BGC-Argo, bien que relativement récente, s'est toutefois exponentiellement développée au cours des dernières années. BGC-Argo représente désormais une des plus importantes bases de données existantes sur la biogéochimie océanique. Elle concerne 6 variables biogéochimiques internationalement identifiées : concentrations en chlorophylle-a (proxy de la biomasse phytoplanctonique), en particules et en nitrates, oxygène dissous, irradiance et pH.

L'Institut de la Mer de Villefranche, le Laboratoire d'Océanographie de Villefranche et l'OSU Ecce Terra (Sorbonne Université/CNRS), en partenariat avec le centre d'océanographie opérationnelle Coriolis, participent activement au niveau international à la mise en place du contrôle qualité et de l'ajustement des variables biogéochimiques acquises par les flotteurs BGC-Argo. L'ajustement et le contrôle qualité des données se déclinent en deux phases : une première série de tests automatiques (effectuée dans les 24h après la collecte des données, mode dit « en temps réel ») et une deuxième, qui implique une expertise scientifique (effectuée dans un intervalle de temps plus long, mode dit « en temps différé »). Ce poste s'inscrit dans le cadre de gestion de données du programme BGC-Argo, i.e. application des algorithmes d'ajustement et validation des données en temps différé.

Le travail se déroulera en collaboration avec les laboratoires et instituts européens impliqués dans le contrôle qualité des 6 variables BGC-Argo ainsi qu'avec les centres opérationnels européens du programme Argo/BGC-Argo (BODC, UK ; Coriolis, FR ; BSH, DE).